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《古今图书集成医部全录》清末有影印本、铅印本，1934年中华书局出版缩印本。
1962年，人民 卫生 出版社将《医部全录》排印分成十二册出版，订为医经注释，脉诊，外诊法，脏腑身形，诸疾，外科，妇科，儿科，总论及列传。艺文、纪事、杂论、外编等(共八个部分)。但将其中“太素脉诀”，“产图”等予以删去，对研究者为一缺憾。
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